产品货号:
WH0126
中文名称:
lncRNA第一链cDNA合成试剂盒(去除基因组DNA)
英文名称:
InRsmart lncRNA First-Strand cDNA Synthesis Kit(With gDNase)
产品规格:
20μl×25次|20μl×100次
发货周期:
1~3天
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本试剂盒是专门针对长链非编码RNA(lncRNA)反转录而开发的产品。与mRNA相比,lncRNA具有丰度低、GC含量差异大、二级结构更复杂等特性,传统反转录试剂对lncRNA难以达到理想的效果。本试剂盒含有高效去除基因组DNA的gDNase,通过42℃,3min即可去除RNA样品中残留的基因组DNA,可有效避免残留的基因组DNA对后续PCR检测结果的干扰。本试剂盒中lnR RT Enzyme Mix中使用的反转录酶为QuickKing RT Enzyme,此酶是通过分子改造后的新型反转录酶,特别增加了疏水motif,具有更强的RNA亲和性和热稳定性,从而进一步提高了其反转录效率和反应速率,42℃、15min即可完成cDNA第一链的合成,且反转录长度至少可达10kb。另外,新型酶与RNA亲和力的更强,配合特殊优化过的缓冲体系和引物体系,使本试剂盒在通读GC含量高,二级结构复杂,低丰度的RNA模板和抗逆性等方面表现突出,特别适合表达水平相对较低,二级结果相对复杂的lncRNA的反转录反应。
- 性能卓越:反转录效率可达95%以上,Total RNA最低检测下限可达10ng,反转录长度可达10kb以上。
- 简单快速:反应体系配制简单,21min完成lncRNA cDNA第一链的合成;
- 适用广泛:能够通用于GC含量差异大,二级结构复杂,低丰度的RNA模板;对不同物种来源及杂质较多的RNA模板的适用性高;
- 兼容性好:后续配合荧光定量检测产品,灵敏度高、稳定性好。
组分 | 25次 | 100次 |
5×gDNA Buffer | 50μL | 200μL |
lnR-RT Primer Mix | 50μL | 200μL |
lnR RT Enzyme Mix | 25μL | 100μL |
10×lnR RT Buffer | 50μL | 200μL |
RNase-Free ddH2O | 1mL | 2×1mL |
保存:-20℃,有效期一年。
- 下列操作步骤适用于模板量为10ng~2μg的Total RNA,如果Total RNA量大于2μg,请按比例扩大反应体系。
- 在冰上进行操作,防止RNA发生降解。
- 对于二级结构很复杂的RNA模板,推荐使用变性步骤,即在操作步骤之前,将模板RNA在65℃孵育5min后迅速转移到冰上,然后再进行下一步操作。
- 根据实验需求不同,也可以选用Oligo-dT Primer或Gene Specific Primer,引物使用量:
Oligo-dT Primer 50pmol/20μL反应体系,
Gene Specific Primer 5pmol/20μL反应体系。 - 当PCR反应有非特异性扩增时,将反转录温度升到50℃会有改善。
10ng~2μg Total RNA可建立20μL反应体系,具体过程如下所示:
- 将模板RNA在冰上解冻;5×gDNA Buffer、lnR-RT Primer Mix、10×lnR RT Buffer、RNase-Free ddH2O在室温(15~25℃)解冻,解冻后迅速置于冰上。使用前将每种溶液涡旋振荡混匀,简短离心以收集残留在管壁的液体。
注意:以下操作步骤请在冰上进行。为了保证反应液配制的准确性,进行各项反应时,应先配制成Mix,然后再分装到每个反应管中。 - 按下表的基因组DNA的去除体系配制混合液,彻底混匀。简短离心,并置于42℃,孵育3min。然后置于冰上放置。
组分 用量 终浓度 Total RNA 10ng~2μg 5×gDNA Buffer 2μL 1× RNase-Free ddH2O 补至10μL - 按下表的反转录反应体系配制混合液。
组分 用量 终浓度 10×lnR RT Buffer 2μL 2× lnR RT Enzyme Mix 1μL - lnR-RT Primer Mix 2μL - RNase-Free ddH2O 补足到10μL - - 将反转录反应中的Mix加到gDNA去除步骤的反应液中,充分混匀后即完成20μL反应体系。
- 42℃,孵育15min。
- 95℃,孵育3min之后放于冰上,得到的cDNA可用于后续实验,或低温保存。
注:- 若后续实验为实时荧光定量PCR,反转录产物的加量应不超过PCR体系终体积的1/10,例如50μL的PCR反应体系,反转录产物的加量应不超过5μL。
- 反转录结束后,请将反转录产物置于冰上,再进行后续PCR反应配制;如果需要长时间保存,请置于-20℃。
- 若后续实验为实时荧光定量PCR,反转录产物的加量应不超过PCR体系终体积的1/10,例如50μL的PCR反应体系,反转录产物的加量应不超过5μL。
对RNA模板的要求:
反转录酶以RNA为模板合成第一链cDNA,模板RNA的质量和数量直接影响反转录的结果。
- 模板的完整性:模板RNA的完整性对反转录非常重要,若RNA模板中含有RNase酶将降解模板RNA,最后导致cDNA产物的量少甚至无cDNA产物。
- 模板的纯度:若RNA模板中含有蛋白、盐离子、EDTA、乙醇、酚等杂质,将影响反转录酶的活性,最后影响反转录结果。
- 模板的加量:上述操作步骤适用于模板RNA量为10ng~2μg,如果模板RNA的量大于2μg,请按比例扩大反应体系。
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